Indépendant, esprit critique, et désireux d'apprendre et d'améliorer ses compétences

Recherche

Doctorant à l'Institut de microbiologie

Le groupe Bertelli du Centre Hospitalier Universitaire Vaudois (Suisse) recherche un doctorant talentueux et motivé pour étudier le microbiote intestinal humain dans une cohorte de population suisse exceptionnelle : la cohorte CoLaus/PsyCoLaus et le rôle du microbiome dans le lien entre obésité et dépression. Le contrat est d'une durée d'un an, renouvelable pour un total de 4 ans.

Contexte

Le Centre Hospitalier Universitaire Vaudois (CHUV) est l'un des cinq hôpitaux universitaires en Suisse. Grâce à sa collaboration avec la Faculté de biologie et de médecine de l'Université de Lausanne et l'EPFL, le CHUV joue un rôle de premier plan dans les soins médicaux, la recherche médicale et la formation.

Mission

Notre laboratoire se lance dans une grande étude interdisciplinaire pour étudier le rôle médiateur possible du microbiote intestinal humain dans le lien connu entre dépression et obésité. Des échantillons seront collectés dans le cadre de la grande cohorte de population CoLaus/PsyCoLaus, reconnue internationalement pour sa caractérisation détaillée des participants incluant à la fois des évaluations psychiatriques et somatiques. À partir des données de métagénomique shotgun du microbiote fécal, vous reconstituerez la composition taxonomique et les capacités fonctionnelles des communautés microbiennes. En collaboration avec d'autres groupes du consortium, vous intégrerez les profils microbiens avec les caractéristiques des participants ainsi que les données métabolomiques pour identifier des signatures de maladies et des mécanismes possibles permettant au microbiote d'impacter le métabolisme de l'hôte et/ou l'humeur.

Notre équipe jeune et dynamique possède une large expérience en laboratoire et en informatique et travaille en collaboration pour analyser de grands ensembles de données, avec des groupes de recherche fondamentale et clinique, notamment au sein du Centre National de Compétence en Recherche sur les Microbiomes (https://nccr-microbiomes.ch/). Nous nous intéressons à déchiffrer les interactions complexes entre le microbiote et son hôte le long de l'axe intestin-cerveau, à comprendre les mécanismes en jeu, et aux stratégies pour moduler le microbiote afin d'améliorer la santé. Vous aurez la possibilité de développer et d'appliquer de nouveaux flux d'analyse utilisant les dernières technologies, dont certaines sont développées dans notre laboratoire. Vous travaillerez en étroite collaboration avec d'autres bioinformaticiens, doctorants, étudiants en master et techniciens du groupe ainsi qu'avec des chercheurs impliqués dans ce projet collaboratif exceptionnel. Vous présenterez des résultats remarquables lors de conférences nationales et/ou internationales, favorisant ainsi de nouvelles collaborations.

Profil

Vous êtes un jeune scientifique motivé, curieux de comprendre le rôle du microbiote dans la santé et la maladie, avec un fort intérêt pour la bioinformatique. Vous avez une formation en biologie, informatique ou statistiques avec un intérêt, et idéalement une expérience, dans l'analyse de données NGS pour obtenir des informations sur la composition, la diversité et la fonction microbiennes. Vous souhaitez élargir vos compétences dans ces disciplines et apporter votre expertise à notre laboratoire. Nous recherchons quelqu'un comme vous !

Compétences essentielles :

• Master en biologie, informatique ou statistiques, idéalement avec une spécialisation en bioinformatique
• Programmation : bash, python ou R
• Connaissance des concepts clés en métagénomique ou génomique microbienne
• Très organisé, capable de travailler de manière autonome et en équipe
• Indépendant, esprit critique, et désireux d'apprendre et d'améliorer ses compétences
• Bonnes compétences en communication pour travailler dans notre environnement de recherche multidisciplinaire.

Nous offrons

Devenir employé du célèbre Centre Hospitalier Universitaire du Canton de Vaud est une garantie de

• Avantages sociaux de premier ordre tels qu'un congé paternité de 20 jours et un congé maternité de 4 mois (il est également possible d'obtenir un congé d'allaitement complémentaire d'un mois) ;
• Progression salariale régulière adaptée à vos responsabilités ;
• Droit à au moins trois jours de formation par an, en accédant à une large offre de cours non seulement du Centre de Formation du CHUV mais aussi de prestataires externes ;
• Possibilité d'accéder à l'un des 500 appartements meublés proposés dans les quartiers environnants en cas de déménagement en Suisse ;
• Réductions proposées sur les événements sociaux et culturels, goodies et autres services, grâce à l'association « H-Oxygène » ;
• Inscription à notre Plan Mobilité et bénéficier de différents avantages (réductions sur les transports publics, promotion de la flotte de voitures « Mobilité » et réductions sur les vélos électriques) ;
• Possibilité de profiter de nos restaurants d'entreprise de haute qualité, situés dans chaque bâtiment hospitalier, avec une réduction pour les employés.

Contact et envoi de candidature

Personne de contact en cas de questions sur ce poste : Prof. Claire Bertelli, experte scientifique, spécialiste en microbiologie, tél : 021 314 40 76

Toutes nos candidatures sont traitées électroniquement. Pour cette raison, nous vous demandons de postuler exclusivement en cliquant sur le bouton POSTULER en bas de l'annonce.

En cas de problème avec votre candidature, vous pouvez consulter notre document "comment postuler en ligne". En cas de problème technique, vous pouvez contacter notre équipe de recrutement qui vous aidera (e.recrutement@chuv.ch / +41 21 314 85 70).

Le CHUV applique les exigences de la plus haute qualité dans le cadre de son processus de recrutement. De plus, soucieux de promouvoir la diversité et l'inclusion au travail, nous nous efforçons d'assurer un traitement égal et d'éviter toute discrimination. Nous attendons avec impatience de recevoir votre candidature.

Nous informons les agences de recrutement externes que toute candidature insérée directement sur notre plateforme de recrutement ne sera pas acceptée et ne pourra pas être facturée. Merci de votre compréhension.