Postdoctorat « ADN environnemental (eDNA) pour une évaluation intégrée des écosystèmes et de la biodiversité » (poste de 2 ans, initiative BiMo Eawag-WSL)
EAWAG Dübendorf, Eidg. Anstalt für Wasser-, Abwasserreinigung & Gewässerschutz
Dübendorf
Infos sur l'emploi
- Date de publication :28 octobre 2025
- Taux d'activité :5 – 100%
- Type de contrat :Durée indéterminée
- Lieu de travail :Dübendorf
Eawag, l'Institut fédéral suisse des sciences et technologies aquatiques, est un institut de recherche aquatique internationalement connecté au sein du domaine ETH (Instituts fédéraux suisses de technologie). Eawag mène des recherches, de la formation et des conseils d'experts pour atteindre les doubles objectifs de répondre aux besoins humains directs en eau et de maintenir la fonction et l'intégrité des écosystèmes aquatiques.
Postdoctorat “ADN environnemental (eDNA) pour une évaluation intégrée des écosystèmes et de la biodiversité” (poste de 2 ans, initiative BiMo Eawag-WSL)
Dans le cadre d'une collaboration Eawag-WSL sur la surveillance innovante de la biodiversité (initiative BiMo), les laboratoires Altermatt, Pellissier et Gross à Eawag et WSL ont un poste vacant pour un
Un élément clé d'une stratégie efficace de biodiversité est une surveillance rapide et évolutive. Au niveau institutionnel, Eawag et WSL possèdent une expertise et une expérience étendues dans les approches innovantes de surveillance de la biodiversité. Dans un développement coordonné, l'initiative novatrice de surveillance de la biodiversité (BiMo) vise à renforcer ce portefeuille de recherche et à générer une mise en œuvre pratique efficace. Le projet met fortement l'accent sur le développement de méthodes et des résultats ayant une grande pertinence pour les parties prenantes. Avec deux autres projets sur la télédétection et la vision par ordinateur, l'initiative BiMo renforcera les capacités d'Eawag et de WSL pour développer et mettre en œuvre des méthodes de surveillance de la biodiversité.
Dans ce projet de postdoctorat, vous utiliserez et ferez progresser les données de métabarcoding eDNA pour une évaluation intégrée des écosystèmes et de la biodiversité. Cela inclut spécifiquement a) l'assemblage des ensembles de données eDNA aquatiques existants et le développement d'indices intégrés de biodiversité et d'écosystème basés sur l'eDNA, b) le travail vers la rationalisation des pipelines eDNA et des protocoles d'analyse, c) le développement collaboratif de propositions de subvention pour l'acquisition de financements externes avec un accent sur les collaborations avec des fondations et l'industrie, et pour étendre/relier aux autres projets BiMo sur la télédétection et l'imagerie. Ce dernier avec un accent sur l'exploration et l'avancement de l'intégration de l'eDNA pour une évaluation de la biodiversité à l'échelle du paysage. Le projet met fortement l'accent sur le développement de méthodes et d'indices, et les résultats du projet doivent être applicables et pertinents pour les parties prenantes.
Ce projet s'appuie sur des ensembles de données eDNA aquatiques déjà établis. Nous développerons d'abord des indicateurs en Suisse, avec des données étendues et une bonne compréhension du système, puis nous étendrons à l'échelle mondiale en utilisant nos bases de données globales. Vous assemblerez et unifierez les ensembles de données disponibles dans une base de données commune incluant l'intégration des variables d'utilisation des terres. Ensuite, vous développerez de nouveaux indicateurs basés sur l'eDNA sur la santé des écosystèmes et dirigerez le développement et la rédaction d'une grande proposition de recherche collaborative visant un financement externe.
Nous recherchons une personne très motivée, enthousiaste et indépendante, passionnée par la science et la mise en œuvre. Vous êtes censé prendre un rôle de leader dans le domaine de la recherche sur le métabarcoding eDNA et la surveillance de la biodiversité, avec un accent sur les évaluations de la diversité dans les écosystèmes d'eau douce utilisant le séquençage à haut débit (HTS).
Pour postuler, vous devez avoir un doctorat en écologie moléculaire, écologie, sciences de la biodiversité ou un domaine scientifique étroitement lié. Idéalement, vous avez une expérience en laboratoire et en bioinformatique dans les approches eDNA ou HTS, ainsi qu'une connaissance approfondie de l'analyse des données de biodiversité. Une expérience en programmation est un atout. Un solide bagage conceptuel en écologie moléculaire et une bonne compréhension de la théorie écologique et de l'analyse des données sont attendus. D'excellentes compétences avérées en rédaction de propositions et en acquisition de financements externes sont fortement souhaitées. La langue de travail dans les groupes est l'anglais. La maîtrise orale et écrite est requise. Des compétences supplémentaires en allemand ou en français sont souhaitables pour les interactions avec les parties prenantes.
Eawag est un employeur moderne offrant un excellent environnement de travail où le personnel peut apporter ses forces, son expérience et ses façons de penser. Nous promouvons l'égalité des sexes et nous engageons en faveur de la diversité et de l'inclusion du personnel. La conciliation entre carrière et famille est pour nous d'une importance centrale. Pour plus d'informations sur Eawag et nos conditions de travail, veuillez consulter www.eawag.ch et www.eawag.ch/en/aboutus/working/employment .
Les candidatures doivent être soumises avant le 30 novembre 2025 et doivent inclure une lettre décrivant vos intérêts et leur pertinence pour ce poste, un CV complet, les diplômes universitaires, ainsi que les noms et coordonnées de trois références (le tout dans un seul fichier pdf).
Pour plus d'informations, veuillez contacter Prof. Dr Florian Altermatt .
Nous attendons votre candidature avec impatience. Veuillez l'envoyer via cette page web, toute autre forme de candidature ne sera pas prise en compte. Un clic sur le bouton ci-dessous vous mènera directement au formulaire de candidature.
Dans ce projet de postdoctorat, vous utiliserez et ferez progresser les données de métabarcoding eDNA pour une évaluation intégrée des écosystèmes et de la biodiversité. Cela inclut spécifiquement a) l'assemblage des ensembles de données eDNA aquatiques existants et le développement d'indices intégrés de biodiversité et d'écosystème basés sur l'eDNA, b) le travail vers la rationalisation des pipelines eDNA et des protocoles d'analyse, c) le développement collaboratif de propositions de subvention pour l'acquisition de financements externes avec un accent sur les collaborations avec des fondations et l'industrie, et pour étendre/relier aux autres projets BiMo sur la télédétection et l'imagerie. Ce dernier avec un accent sur l'exploration et l'avancement de l'intégration de l'eDNA pour une évaluation de la biodiversité à l'échelle du paysage. Le projet met fortement l'accent sur le développement de méthodes et d'indices, et les résultats du projet doivent être applicables et pertinents pour les parties prenantes.
Ce projet s'appuie sur des ensembles de données eDNA aquatiques déjà établis. Nous développerons d'abord des indicateurs en Suisse, avec des données étendues et une bonne compréhension du système, puis nous étendrons à l'échelle mondiale en utilisant nos bases de données globales. Vous assemblerez et unifierez les ensembles de données disponibles dans une base de données commune incluant l'intégration des variables d'utilisation des terres. Ensuite, vous développerez de nouveaux indicateurs basés sur l'eDNA sur la santé des écosystèmes et dirigerez le développement et la rédaction d'une grande proposition de recherche collaborative visant un financement externe.
Nous recherchons une personne très motivée, enthousiaste et indépendante, passionnée par la science et la mise en œuvre. Vous êtes censé prendre un rôle de leader dans le domaine de la recherche sur le métabarcoding eDNA et la surveillance de la biodiversité, avec un accent sur les évaluations de la diversité dans les écosystèmes d'eau douce utilisant le séquençage à haut débit (HTS).
Pour postuler, vous devez avoir un doctorat en écologie moléculaire, écologie, sciences de la biodiversité ou un domaine scientifique étroitement lié. Idéalement, vous avez une expérience en laboratoire et en bioinformatique dans les approches eDNA ou HTS, ainsi qu'une connaissance approfondie de l'analyse des données de biodiversité. Une expérience en programmation est un atout. Un solide bagage conceptuel en écologie moléculaire et une bonne compréhension de la théorie écologique et de l'analyse des données sont attendus. D'excellentes compétences avérées en rédaction de propositions et en acquisition de financements externes sont fortement souhaitées. La langue de travail dans les groupes est l'anglais. La maîtrise orale et écrite est requise. Des compétences supplémentaires en allemand ou en français sont souhaitables pour les interactions avec les parties prenantes.
Le projet est dirigé par Prof. Dr Florian Altermatt (Eawag/UZH), Dr Andrin Gross (WSL), et Prof. Dr Loïc Pellissier (WSL/ETHZ). Ce poste sera dans le groupe du Prof. Dr Florian Altermatt ( www.altermattlab.ch ) à Eawag (Dübendorf, Suisse). Le projet implique une collaboration étendue entre les trois groupes, ainsi que des parties prenantes nationales et cantonales. Le poste est entièrement financé pour deux ans et devrait commencer au premier trimestre 2026.
Eawag est un employeur moderne offrant un excellent environnement de travail où le personnel peut apporter ses forces, son expérience et ses façons de penser. Nous promouvons l'égalité des sexes et nous engageons en faveur de la diversité et de l'inclusion du personnel. La conciliation entre carrière et famille est pour nous d'une importance centrale. Pour plus d'informations sur Eawag et nos conditions de travail, veuillez consulter www.eawag.ch et www.eawag.ch/en/aboutus/working/employment .
Les candidatures doivent être soumises avant le 30 novembre 2025 et doivent inclure une lettre décrivant vos intérêts et leur pertinence pour ce poste, un CV complet, les diplômes universitaires, ainsi que les noms et coordonnées de trois références (le tout dans un seul fichier pdf).
Pour plus d'informations, veuillez contacter Prof. Dr Florian Altermatt .
Nous attendons votre candidature avec impatience. Veuillez l'envoyer via cette page web, toute autre forme de candidature ne sera pas prise en compte. Un clic sur le bouton ci-dessous vous mènera directement au formulaire de candidature.
Eawag : Institut fédéral suisse des sciences et technologies aquatiques
