Stage de Data Science - Intelligence artificielle appliquée aux données hospitalières - 100%

Avec plus de 13'000 collaborateurs et collaboratrices représentant 160 métiers, les Hôpitaux Universitaires de Genève (HUG) sont un établissement de référence au niveau national et international. Pour en savoir plus sur notre institution, prenez quelques minutes pour consulter notre rétrospective 2025 en cliquant ici .

La Direction médicale et qualité a pour mission de garantir la qualité et la sécurité des prestations médicales offertes par les Hôpitaux Universitaires de Genève. Le Service prévention et contrôle de l’infection (SPCI) a pour mission le contrôle et la prévention des infections et des réservoirs de microorganismes résistants en milieu hospitalier. Le service se compose de médecins infectiologues ayant des fonctions cliniques et de recherche, d'une équipe d’infirmiers et infirmières spécialisées, d’épidémiologistes, de data scientists et d’informaticiennes et informaticiens. Le service est également un centre de collaboration de l'organisation mondiale de la santé (OMS) pour la prévention et le contrôle de l’infection et la résistance aux antibiotiques.

Les bactéries résistantes aux antibiotiques représentent un défi majeur pour les systèmes de santé. Les Hôpitaux Universitaires de Genève développent des approches innovantes combinant épidémiologie hospitalière, science des données et intelligence artificielle afin d’améliorer la détection précoce des patientes et patients porteurs de bactéries multirésistantes.

Dans ce contexte, nous développons le projet SEARCH-AI financé par la Fondation Privée des HUG, dont l’objectif est d’optimiser le dépistage ciblé de porteurs de bactéries multirésistantes (ESBL, CPE, VRE) à l’admission et durant le séjour à l’hôpital à l’aide de modèles de machine learning appliqués aux données cliniques hospitalières.

Dans le cadre de votre stage, vous participez au développement et à l’évaluation de modèles prédictifs permettant d’identifier la patientèle à risque de portage de bactéries résistantes.

Les principales missions incluent:

le pré-retraitement et la structuration de bases de données cliniques hospitalières (dossiers patients, microbiologie, historiques d’hospitalisation);
Feature engeneering à partir de données médicales longitudinales;
Développement et comparaison de modèles de machine learning (régression logistique pénalisée, LASSO, modèles d’arbres, XGBoost, etc);
Evaluation des performances des modèles et analyse d’interprétabilité (SHAP ou méthodes similaires);
Contribution à la documentation du pipeline analytique;
Participation aux discussions scientifiques avec une équipe multidisciplinaire (cliniciens, épidémiologistes, data scientists)

Selon l’avancement du projet, le stage pourra contribuer à une publication scientifique ou une présentation à une conférence internationale.

Ce stage est destiné à des étudiants et étudiantes de fin d’études (Master ou école d’ingénieur) avec une spécialisation en data science, machine learning, bioinformatique et statistiques appliquées ou informatiques et vous êtes en possession d’une convention de stage.

Vous possédez une bonne maîtrise de Python ou R pour l’analyse de données, vous avez des connaissances en machine learning supervisé ainsi que des bases solides en statistiques et modélisation.

Vous avez de l’expérience avec la manipulation de grandes bases de données et un intérêt prononcé pour les applications de l’IA en santé ou biomédecine. En outre, une expérience avec des données médicales ou biologiques, des connaissances en épidémiologie ou santé publique ainsi que la familiarité avec les méthodes d’interprétabilité des modèles seront considérés comme atouts.

Une bonne maîtrise de l’anglais est également souhaitée.

• Entrée en fonction: A convenir
• Nombre de poste: 1
• Taux d’activité: 100%
• Type de contrat: CDD de 6 mois soumis à Convention
• Délai de candidature: 17.04.2026
• Demande de renseignement: Écrire un email

Votre dossier de candidature doit comporter une lettre démontrant votre motivation, votre curriculum vitae, les copies des diplômes et attestations requis pour le poste et les 2 derniers certificats de travail.

Cette annonce s'adresse indistinctement aux femmes et aux hommes.

Seules les candidatures soumises via la plateforme de recrutement sont prises en compte. Les candidatures papier et mail ne seront pas traitées.