Poste de doctorant en gastroentérologie et immunologie muqueuse à l'Université de Berne

Département de recherche biomédicale, UVCM, Gastroentérologie
Début de l'emploi : 01.03.2026 ou dès que possible
Le groupe Zeissig à la Division de gastroentérologie et immunologie muqueuse du Département de recherche biomédicale de l'Université de Berne recherche un postdoctorant.

Notre groupe s'intéresse aux mécanismes contribuant à la pathogenèse de l'inflammation intestinale chronique et du cancer colorectal (CRC). Un accent particulier est mis sur les interactions hôte-microbes et le dialogue entre métabolisme et immunité dans l'inflammation et le cancer. Dans des travaux récents, nous avons identifié des voies d'interactions hôte-microbes qui contribuent au développement et à la progression du CRC par l'activation de voies favorisant la tumeur dans l'épithélium intestinal (Peuker et al., Nat. Med. 2016). De plus, nous avons montré que la détection microbienne par les cellules myéloïdes infiltrant la tumeur favorise la progression du CRC en régulant le dialogue entre les cellules épithéliales et les lymphocytes T CD8+ cytotoxiques (Peuker et al., Immunity 2022). Mon groupe a récemment déménagé à l'Université de Berne le 1er octobre 2025 et maintient un laboratoire actif supplémentaire à Greifswald, en Allemagne.

Le cancer colorectal à début précoce (EOCRC), défini comme un diagnostic de CRC avant l'âge de 50 ans, a connu une augmentation substantielle de son incidence ces dernières décennies et est souvent diagnostiqué à des stades avancés avec métastases ganglionnaires et à distance. Dans le projet proposé, nous étudions donc comment l'âge de l'hôte influence les métastases du CRC par la régulation de l'immunité anti-cancer et du métabolisme tumoral. Les études seront principalement réalisées sur des modèles murins de CRC, avec des travaux de confirmation sur des tissus humains de CRC.

Nous nous concentrerons sur des investigations mécanistiques utilisant le séquençage ARN et la métabolomique, en conjonction avec des interférences fonctionnelles sur les voies immunologiques et métaboliques chez la souris et dans des cultures d'organoïdes ex vivo. Pour étudier les interactions hôte-microbes dans la régulation dépendante de l'âge des métastases du CRC, des études seront partiellement menées avec des souris gnotobiotiques à la Bern Clean Mouse Facility (CMF). L'objectif à long terme de ce projet est d'identifier des voies pharmacologiquement ciblables qui régulent la progression du CRC. Le poste est proposé pour notre laboratoire à l'Université de Berne, situé au Département de recherche biomédicale (DBMR) et le travail sera exclusivement effectué à Berne.

Les candidats doivent être titulaires d'un doctorat en immunologie, microbiologie, biologie moléculaire, biotechnologie, sciences animales ou dans tout autre domaine lié aux sciences biologiques. Une expertise en culture cellulaire et en études sur souris est idéale. Comme le travail implique l'analyse de données transcriptomiques spatiales, une expertise de base en biologie computationnelle, avec une expérience en R et/ou Python, sera un atout. Une excellente maîtrise de l'anglais (oral et écrit) est requise.



Prof. Dr. med. Sebastian Zeissig, titulaire de la chaire de gastroentérologie, et PD Dr. Stephanie Ganal-Vonarburg, responsable du groupe de recherche en gastroentérologie et immunologie muqueuse, Département de recherche biomédicale et Département de chirurgie viscérale et médecine, stephanie.ganal@unibe.ch

Veuillez envoyer votre candidature en un seul fichier PDF nommé "application_prénom.nom" à la personne de contact (stephanie.ganal@unibe.ch) en indiquant "Postdoc position colorectal cancer" dans l'objet du mail.

Le fichier doit inclure
1. lettre de motivation
2. curriculum vitae (le format de date doit être mm/aaaa),
3. copies des diplômes et relevés de notes,
4. coordonnées de 1 à 2 anciens superviseurs pour référence,
5. liste des publications (ne pas inclure vos publications dans le fichier pdf).
 
La date limite de candidature est le 25.01.2026