Postdoctorat sur les méthodes moléculaires pour la détection des agents pathogènes infectieux dans les eaux usées
EAWAG Dübendorf, Eidg. Anstalt für Wasser-, Abwasserreinigung & Gewässerschutz
Dübendorf
Infos sur l'emploi
- Date de publication :04 octobre 2025
- Taux d'activité :100%
- Type de contrat :Durée indéterminée
- Lieu de travail :Dübendorf
Résumé de l'emploi
Eawag, Institut Fédéral Suisse des Sciences Aquatiques, recherche un postdoc. Ce poste offre un environnement de recherche dynamique et collaboratif.
Tâches
- Développer des méthodes pour détecter des agents pathogènes dans les eaux usées.
- Appliquer des techniques de séquençage et d'enrichissement génique.
- Collaborer avec des chercheurs sur la surveillance environnementale.
Compétences
- Doctorat en microbiologie, biologie moléculaire ou domaine connexe requis.
- Expérience en méthodes moléculaires, extraction d'ARN/DNA.
- Compétences en bioinformatique et séquençage.
Est-ce utile ?
Eawag, l'Institut fédéral suisse des sciences et technologies aquatiques, est un institut de recherche aquatique internationalement connecté au sein du domaine ETH (Instituts fédéraux suisses de technologie). Eawag mène des recherches, de la formation et des conseils d'experts pour atteindre les doubles objectifs de répondre aux besoins humains directs en eau et de maintenir la fonction et l'intégrité des écosystèmes aquatiques.
Postdoctorat sur les méthodes moléculaires pour la détection des agents pathogènes infectieux dans les eaux usées
Le laboratoire de surveillance des eaux usées d'Eawag surveille activement les eaux usées pour des données pertinentes en santé publique, incluant le suivi des dynamiques et des séquences des agents pathogènes respiratoires SARS-CoV-2, Influenza A, Influenza B et RSV. Notre travail a conduit à des séries temporelles de données provenant de 10 stations d'épuration à travers la Suisse, à la traduction des données en nombres de reproduction effectifs dérivés des eaux usées, ainsi qu'à des séries temporelles de variation génomique de la grippe, du RSV et du SARS-CoV-2 à partir des eaux usées.
Dans ce contexte, nous développons et appliquons des méthodes pour la détection, la quantification et le séquençage des agents pathogènes ainsi que d'autres marqueurs biologiques et chimiques d'intérêt pour la santé publique dans les eaux usées. Le poste proposé est axé sur l'amélioration de ces méthodes, incluant le développement supplémentaire de l'enrichissement des gènes cibles viraux et bactériens, des tests numériques multiplexés et des approches de séquençage. Les nouvelles méthodes seront rapidement appliquées aux efforts de surveillance en cours, avec pour objectif de transférer ces nouvelles méthodes et connaissances aux parties prenantes concernées. Ce travail sera réalisé dans le cadre d'un grand projet interdisciplinaire incluant des microbiologistes environnementaux, des ingénieurs environnementaux, des épidémiologistes et des bioinformaticiens. L'objectif du projet est de faire progresser la surveillance environnementale des eaux usées afin d'en extraire des informations de santé publique en Suisse et à l'international.
Si vous êtes passionné par ce sujet et que vous avez une formation (Ph.D.) en microbiologie, biologie moléculaire, sciences de l'environnement, génie de l'environnement, santé publique ou domaine connexe, vous êtes invité à postuler. Une expérience préalable des méthodes moléculaires, incluant l'extraction d'ARN/ADN et la qPCR/dPCR, est nécessaire, tout comme une formation en bioinformatique. Une expérience en laboratoire en virologie et en séquençage (PacBio, Illumina et/ou Nanopore) est un atout. Nous attendons du candidat qu'il interagisse avec plusieurs collaborateurs académiques, gouvernementaux et non gouvernementaux, y compris des chercheurs internationaux de premier plan dans le domaine. Le candidat doit être disposé à travailler en équipe. Nous offrons un environnement de recherche très dynamique et collaboratif qui bénéficie d'une infrastructure et d'un soutien à la pointe de la technologie.
L'évaluation des candidatures commencera le 22 novembre 2025 et se poursuivra jusqu'à ce que le poste soit pourvu. La date de début est prévue pour janvier 2026 mais reste flexible selon la disponibilité du candidat. Veuillez inclure une lettre de motivation (1 page max.) expliquant pourquoi vous pensez correspondre bien à ce poste, une brève description de vos recherches antérieures, un CV, ainsi que les noms et coordonnées de deux références.
Eawag est un employeur moderne offrant un excellent environnement de travail où le personnel peut apporter ses forces, son expérience et ses modes de pensée. Nous promouvons l'égalité des sexes et nous engageons en faveur de la diversité et de l'inclusion du personnel. La conciliation entre carrière et famille est pour nous d'une importance centrale. Pour plus d'informations sur Eawag et nos conditions de travail, veuillez consulter www.eawag.ch et www.eawag.ch/en/aboutus/working/employment .
Pour plus d'informations, veuillez contacter Dr Tim Julian .
Nous attendons avec impatience de recevoir votre candidature. Veuillez l'envoyer via cette page web, toute autre forme de candidature ne sera pas prise en compte. Un clic sur le bouton ci-dessous vous mènera directement au formulaire de candidature.
Dans ce contexte, nous développons et appliquons des méthodes pour la détection, la quantification et le séquençage des agents pathogènes ainsi que d'autres marqueurs biologiques et chimiques d'intérêt pour la santé publique dans les eaux usées. Le poste proposé est axé sur l'amélioration de ces méthodes, incluant le développement supplémentaire de l'enrichissement des gènes cibles viraux et bactériens, des tests numériques multiplexés et des approches de séquençage. Les nouvelles méthodes seront rapidement appliquées aux efforts de surveillance en cours, avec pour objectif de transférer ces nouvelles méthodes et connaissances aux parties prenantes concernées. Ce travail sera réalisé dans le cadre d'un grand projet interdisciplinaire incluant des microbiologistes environnementaux, des ingénieurs environnementaux, des épidémiologistes et des bioinformaticiens. L'objectif du projet est de faire progresser la surveillance environnementale des eaux usées afin d'en extraire des informations de santé publique en Suisse et à l'international.
Si vous êtes passionné par ce sujet et que vous avez une formation (Ph.D.) en microbiologie, biologie moléculaire, sciences de l'environnement, génie de l'environnement, santé publique ou domaine connexe, vous êtes invité à postuler. Une expérience préalable des méthodes moléculaires, incluant l'extraction d'ARN/ADN et la qPCR/dPCR, est nécessaire, tout comme une formation en bioinformatique. Une expérience en laboratoire en virologie et en séquençage (PacBio, Illumina et/ou Nanopore) est un atout. Nous attendons du candidat qu'il interagisse avec plusieurs collaborateurs académiques, gouvernementaux et non gouvernementaux, y compris des chercheurs internationaux de premier plan dans le domaine. Le candidat doit être disposé à travailler en équipe. Nous offrons un environnement de recherche très dynamique et collaboratif qui bénéficie d'une infrastructure et d'un soutien à la pointe de la technologie.
L'évaluation des candidatures commencera le 22 novembre 2025 et se poursuivra jusqu'à ce que le poste soit pourvu. La date de début est prévue pour janvier 2026 mais reste flexible selon la disponibilité du candidat. Veuillez inclure une lettre de motivation (1 page max.) expliquant pourquoi vous pensez correspondre bien à ce poste, une brève description de vos recherches antérieures, un CV, ainsi que les noms et coordonnées de deux références.
Eawag est un employeur moderne offrant un excellent environnement de travail où le personnel peut apporter ses forces, son expérience et ses modes de pensée. Nous promouvons l'égalité des sexes et nous engageons en faveur de la diversité et de l'inclusion du personnel. La conciliation entre carrière et famille est pour nous d'une importance centrale. Pour plus d'informations sur Eawag et nos conditions de travail, veuillez consulter www.eawag.ch et www.eawag.ch/en/aboutus/working/employment .
Pour plus d'informations, veuillez contacter Dr Tim Julian .
Nous attendons avec impatience de recevoir votre candidature. Veuillez l'envoyer via cette page web, toute autre forme de candidature ne sera pas prise en compte. Un clic sur le bouton ci-dessous vous mènera directement au formulaire de candidature.
Eawag : Institut fédéral suisse des sciences et technologies aquatiques
