Chercheur post-doctoral en infrastructure de surveillance génomique mondiale (80 – 100%)
Infos sur l'emploi
- Date de publication :18 juillet 2025
- Taux d'activité :80 – 100%
- Type de contrat :Durée indéterminée
- Lieu de travail :Allschwil
Résumé de l'emploi
L'Institut Tropical et de Santé Publique Suisse (Swiss TPH) se consacre à la santé mondiale, particulièrement dans les pays à revenu faible et intermédiaire. Rejoignez une équipe dynamique qui favorise la recherche et l'innovation en santé.
Tâches
- Développer une infrastructure mondiale pour le séquençage des pathogènes.
- Collaborer avec des leaders internationaux en épidémiologie et phylogénétique virale.
- Contribuer à des projets comme ARTIC2 et Pathoplexus pour partager des données.
Compétences
- Doctorat en biologie computationnelle ou domaine connexe requis.
- Compétences en analyse de données génomiques et bioinformatique.
- Expérience en développement de systèmes de partage de données.
Est-ce utile ?
L'Institut tropical et de santé publique suisse (Swiss TPH) est un institut de premier plan dans le domaine de la santé mondiale, avec un accent particulier sur les pays à revenu faible et intermédiaire. Associé à l'Université de Bâle, Swiss TPH combine recherche, éducation et services à des niveaux local, national et international. 950 personnes provenant de 95 nations travaillent à Swiss TPH, se concentrant sur les maladies infectieuses et non transmissibles, l'environnement, la société et la santé, ainsi que sur les systèmes de santé et les interventions.
Le Département de parasitologie médicale et de biologie de l'infection (MPI) étudie la biologie et la transmission des agents pathogènes. Les résultats de cette recherche informent le développement de nouveaux diagnostics, traitements et vaccins contre le paludisme, la tuberculose, la schistosomiase, la maladie de Chagas et d'autres maladies tropicales négligées.
Chercheur post-doctoral en infrastructure de surveillance génomique mondiale (80 – 100%)
Êtes-vous enthousiasmé par l'idée de construire une infrastructure mondiale pour rendre le séquençage des agents pathogènes plus accessible, interprétable et équitable ? Ce poste post-doctoral offre une opportunité unique de travailler à l'intersection de deux efforts de premier plan :
- ARTIC2, la dernière évolution du projet ARTIC renommé, permettant un séquençage génétique abordable, portable et en temps réel dans des environnements à faibles ressources
- Pathoplexus, une plateforme open-source pionnière redéfinissant la manière dont les données de séquence virale sont partagées et gouvernées à l'échelle mondiale, alimentée par le logiciel de base de données fédéré et modulaire Loculus
Il s'agit d'un poste computationnel axé sur la recherche, le développement et l'application de systèmes pour la curation, l'analyse et le partage des données génomiques des agents pathogènes. Vous rejoindrez le groupe Épidémiologie & Évolution virale (EVE) à Swiss TPH, travaillant aux côtés de leaders internationaux en science ouverte, épidémiologie génomique et phylogénétique virale.
Comment postuler :
Veuillez soumettre votre candidature en ligne.
- CV, y compris la liste des publications
- Lettre de motivation, incluant votre parcours & expérience, et ce que vous envisagez d'apporter au projet
- Noms et coordonnées (email) de 2-3 références
- Diplômes obtenus
La date limite de candidature est le 31 août 2025, mais les candidatures seront examinées dès leur soumission.
Nous encourageons particulièrement les candidatures provenant de milieux sous-représentés en biologie computationnelle. Ensemble, nous pouvons rendre le monde plus sain. Nous avons hâte de recevoir votre candidature.
Veuillez noter que nous ne pouvons accepter les candidatures que via notre outil de recrutement en ligne. Tant que le poste est en ligne sur notre site web, nous sommes ouverts à de nouvelles candidatures. Les candidatures par e-mail ou par des recruteurs externes ne seront pas prises en compte.
La vie à Bâle/Allschwil/Suisse :
La qualité de vie en Suisse est constamment classée parmi les plus élevées au monde. La Suisse est un pays sûr et stable avec des salaires relativement élevés, un climat tempéré et une nature et des montagnes magnifiques et accessibles.
La région de Bâle est véritablement internationale, avec de nombreux résidents étrangers en raison des universités et de l'industrie pharmaceutique. Elle dispose d'un aéroport international, de près de 40 musées, de nombreux festivals (y compris l'Art Basel de renommée internationale) et d'une rivière suffisamment propre pour nager en plein centre-ville (et nous le faisons !). La région de Bâle est nichée à côté de la France et de l'Allemagne, élargissant encore son ambiance internationale et l'opportunité d'explorations internationales à quelques minutes de voyage. La ville et la région sont adaptées aux cyclistes et offrent d'excellents transports publics à courte et longue distance.
Contact :
Veuillez envoyer un e-mail à applications@hodcroft.com pour des questions informelles.
